MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017425	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826554
3	NC_017425	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387826554
4	NC_017425	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
5	NC_017425	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826554
6	NC_017425	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826554
7	NC_017425	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826554
8	NC_017425	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826554
9	NC_017425	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826554
10	NC_017425	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826554
11	NC_017425	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826554
12	NC_017425	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
13	NC_017425	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826554
14	NC_017425	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826554
15	NC_017425	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826554
16	NC_017425	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826554
17	NC_017425	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826554
18	NC_017425	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826554
19	NC_017425	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826554
20	NC_017425	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826554
21	NC_017425	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826554
22	NC_017425	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826554
23	NC_017425	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826554
24	NC_017425	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826554
25	NC_017425	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826554
26	NC_017425	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826554
27	NC_017425	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826554
28	NC_017425	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826555
29	NC_017425	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826555
30	NC_017425	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826555
31	NC_017425	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826555
32	NC_017425	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387826555
33	NC_017425	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387826555
34	NC_017425	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826555
35	NC_017425	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826555
36	NC_017425	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826555
37	NC_017425	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826555
38	NC_017425	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387826555
39	NC_017425	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826556
40	NC_017425	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	387826556
41	NC_017425	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826556
42	NC_017425	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826556
43	NC_017425	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826556
44	NC_017425	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387826556
45	NC_017425	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	387826556
46	NC_017425	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387826556
47	NC_017425	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387826556
48	NC_017425	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	387826556
49	NC_017425	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826556
50	NC_017425	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826557
51	NC_017425	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	387826557
52	NC_017425	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826557
53	NC_017425	AGT	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826557
54	NC_017425	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387826557
55	NC_017425	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826557
56	NC_017425	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	387826557
57	NC_017425	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	387826557
58	NC_017425	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	387826557
59	NC_017425	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826557
60	NC_017425	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826557
61	NC_017425	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387826557
62	NC_017425	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	387826557
63	NC_017425	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826557
64	NC_017425	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017425	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	387826558
66	NC_017425	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826558
67	NC_017425	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	387826558
68	NC_017425	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826558
69	NC_017425	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826558
70	NC_017425	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826558
71	NC_017425	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826558
72	NC_017425	TAG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826558
73	NC_017425	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826558
74	NC_017425	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	387826558
75	NC_017425	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826558
76	NC_017425	AGG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017425	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
78	NC_017425	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826559
79	NC_017425	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
80	NC_017425	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
81	NC_017425	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	387826559
82	NC_017425	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826559
83	NC_017425	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
84	NC_017425	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387826559
85	NC_017425	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826559
86	NC_017425	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826559
87	NC_017425	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
88	NC_017425	ACT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826559
89	NC_017425	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826559
90	NC_017425	GATAAA	2	12	4479	4490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826559
91	NC_017425	A	6	6	4507	4512	100 %	0 %	0 %	0 %	387826559
92	NC_017425	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826559
93	NC_017425	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826559
94	NC_017425	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826559
95	NC_017425	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826559
96	NC_017425	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826559
97	NC_017425	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826559
98	NC_017425	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826559
99	NC_017425	AGTA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	387826559
100	NC_017425	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	387826559
101	NC_017425	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	387826559
102	NC_017425	GGT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826559
103	NC_017425	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826559
104	NC_017425	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826560
105	NC_017425	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	387826560
106	NC_017425	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826560
107	NC_017425	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826560
108	NC_017425	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	387826560
109	NC_017425	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826560
110	NC_017425	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826560
111	NC_017425	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826560
112	NC_017425	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826560
113	NC_017425	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826560
114	NC_017425	G	6	6	5295	5300	0 %	0 %	100 %	0 %	387826560
115	NC_017425	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387826560
116	NC_017425	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	387826560
117	NC_017425	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826561
118	NC_017425	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826561
119	NC_017425	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826561
120	NC_017425	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826561
121	NC_017425	ATTTA	2	10	5695	5704	40 %	60 %	0 %	0 %	387826561
122	NC_017425	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826562
123	NC_017425	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387826562
124	NC_017425	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826562
125	NC_017425	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826562
126	NC_017425	TAT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826562
127	NC_017425	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	387826562
128	NC_017425	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826562
129	NC_017425	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826562
130	NC_017425	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826562
131	NC_017425	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826563
132	NC_017425	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826563
133	NC_017425	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826563
134	NC_017425	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
135	NC_017425	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
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137	NC_017425	TAAT	2	8	6602	6609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
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272	NC_017425	GAT	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826570
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399	NC_017425	AATTTA	2	12	16877	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	387826580
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